Στο ΕΜΔΔ υπάρχουν δύο διαδικασίες για την ίδια διαδικασία:

Η διαδικασία 469266 σχετικά με την ανάρτηση πρακτικών καινοτομίας στο Αποθετήριο Πρακτικών Καινοτομίας Δημόσιου Τομέα και η διαδικασία 686701 σχετικά με την Υποβολή πρακτικών καινοτομίας στο Αποθετήριο Πρακτικών Καινοτομίας Δημοσίου Τομέα, η οποία λόγω της πλατφόρμας που έχει αναπτύξει το Τμήμα Καινοτομίας & Βέλτιστων Πρακτικών ΥΠΕΣ. Συνεπώς θα πρέπει να διερευνηθεί εάν θα πρέπει να παραμείνει μόνο η τελευταία διαδικασία (686701) και όχι και η προγενέστερη (469266).